Assegurar a proteção das populações residentes de boto da espécie Sotalia fluviatilis, a sua área de alimentação e reprodução, bem como a de remanescentes da Floresta Pluvial Atlântica e fontes hídricas de relevante interesse para a sobrevivência das comunidades de pescadores artesanais da região. Foi criada pelo decreto nº 528 de 20.05.1992.
A unidade foi criada por solicitação do arquiteto André Ferreira, devido a presença de golfinhos da espécie Sotalia fluviatilis e do remanescente de Floreta Atlântica. Está área já foi uma antiga armação baleeira, a maior do sul do Brasil. É colonizada por descendentes de açorianos. O nome da APA é devido a ilha de mesmo nome. Nesta ilha existe uma fortaleza que foi edificada pelos portugueses por volta de 1735, a qual virou prisão política na época de Floriano Peixoto.
Possui uma área de 3.000 ha e perímetro de 30 Km. Está localizada no estado de Santa Catarina, no município de Governador Celso Ramos. O acesso pode ser feito através da BR-101, em direção a Celso Ramos; ou por via marítima, pela Baía Norte, que é a mais procurada pelos turistas. A cidade mais próxima à unidade é Celso Ramos que fica a 34 Km de distância da capital.As atrações mais procuradas pelos turistas são os passeios de embarcação com escunas, que fazem o percurso até as fortalezas de Santo Antônio, na ilha de Ratones Grande e na Fortaleza de Santa Cruz, na ilha de Anhatomirim, com passagem pela Baía dos Golfinhos.
A porção continental da APA, pelo contrário, possui expressiva cobertura de floresta atlântica. O total da área abrangida é de 3.000 ha. Esta unidade de conservação inclui também uma pequena porção marinha, para proteger uma população do golfinho Sotalia fluviatilis que vive nas enseadas da região.A atividade turística de visitação para observação dos golfinhos ("dolphin-watching"), quando em excesso e sem regulamentação, tem causado perturbações a estes animais. Tal fato tem gerado protestos de pesquisadores e ambientalistas, que sugerem até mesmo a proibição deste tipo de atividade, caso regras rígidas de regulamentação não sejam adotadas.
Fonte:Ibama

